(1)盛裝待測比色液的容器不再使用比色皿，而是使用塑料微孔板。微孔板常用透明的聚乙烯材料制成，對抗原抗體有較強(qiáng)的吸附作用，故用它作為固相載體。

(2)由于盛樣本的塑料微孔板是多排多孔的，光線只能垂直穿過，因此酶標(biāo)儀的光束都是垂直通過待測溶液和微孔板的，光束既可是從上到下，也可以是從下到上穿過比色液。

(3)酶標(biāo)儀通常不僅用A，有時(shí)也使用光密度OD來表示吸光度。

酶標(biāo)儀可分為單通道和多通道2種類型，單通道又有自動和手動2種之分。自動型的儀器有X,Y方向的機(jī)械驅(qū)動機(jī)構(gòu)，可將微孔板L的小孔一個(gè)個(gè)依次送入光束下面測試，手動型則靠手工移動微孔板來進(jìn)行測量。

在單通道酶標(biāo)儀的基礎(chǔ)上又發(fā)展了多通道酶標(biāo)儀，此類酶標(biāo)儀一般都是自動化型的。它沒有多個(gè)光束和多個(gè)光電檢測器，如12個(gè)通道的儀器設(shè)有12條光束或12個(gè)光源，12個(gè)檢測器和12個(gè)放大器，在X方向的機(jī)械驅(qū)動裝置的作用下，樣品12個(gè)為一排被檢測。多通道酶標(biāo)儀的檢測速度快，但其結(jié)構(gòu)較復(fù)雜價(jià)格也較高。